More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1417 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  56.95 
 
 		 295 aa  332  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  56.61 
 
 		 295 aa  330  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  53.24 
 
 		 307 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  57.58 
 
 		 297 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  54.79 
 
 		 297 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  57.24 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  56.9 
 
 		 297 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  54.76 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  56.08 
 
 		 297 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  54.42 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  51.88 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  54.39 
 
 		 297 aa  300  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  53.06 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  53.4 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  48.97 
 
 		 294 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  53.42 
 
 		 299 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  52.05 
 
 		 294 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  53.08 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  50.85 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  54.76 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  48.31 
 
 		 312 aa  286  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  50.52 
 
 		 300 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  47.95 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  49.14 
 
 		 300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  48.8 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  53.06 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  52.72 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  46.44 
 
 		 337 aa  271  9e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  48.65 
 
 		 295 aa  268  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  51.27 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  45.55 
 
 		 294 aa  261  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  53.56 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  49.48 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.55 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  47.06 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  46.98 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  46.44 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  47.02 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  44.22 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  48.58 
 
 		 306 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  48.16 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  50.84 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  45.58 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  46.33 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  43.11 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  48.29 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  48.29 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  47.95 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  47.95 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.35 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  42.31 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  47.6 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  42.31 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  45.7 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  47.81 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 299 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  47.96 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  45.52 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  44.49 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  48.29 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  48.29 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  46.6 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.84 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  42.47 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  43.85 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  46.43 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  41.28 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  43.31 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  43.31 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.19 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  42.03 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  49.26 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  48.33 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  45.02 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  45.02 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  45 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  46.21 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  41.34 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  45.91 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  45.7 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  47.78 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  50.21 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>