More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0608 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  78.64 
 
 		 309 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  78.64 
 
 		 309 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  72.91 
 
 		 320 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  69.8 
 
 		 309 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  71.81 
 
 		 316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  66.55 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  58.61 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  58.9 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  58.7 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  58.56 
 
 		 299 aa  346  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  55.97 
 
 		 300 aa  338  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  55.37 
 
 		 337 aa  338  5e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  57 
 
 		 295 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  57.93 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  57 
 
 		 295 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  58.28 
 
 		 300 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  56.31 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  56.9 
 
 		 300 aa  330  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  60.48 
 
 		 296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  60.48 
 
 		 296 aa  322  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  53.24 
 
 		 296 aa  322  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  55.85 
 
 		 297 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  51.54 
 
 		 297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  50.52 
 
 		 294 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  54.58 
 
 		 297 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  54.58 
 
 		 297 aa  298  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  53.56 
 
 		 297 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  53.54 
 
 		 297 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 295 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  50.34 
 
 		 297 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  52.7 
 
 		 296 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  47.85 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  49.14 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  46.6 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  46.9 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.45 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  46.13 
 
 		 299 aa  248  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  45.33 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  51.87 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  51.53 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  46.96 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  46.96 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.93 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.96 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  46.67 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  46.67 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  46.67 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  51.1 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  46.67 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  46.67 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  44.95 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  47.12 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  47.12 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  44.33 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  41.87 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  48.14 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  44.56 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  45.67 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 295 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  43.81 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  44.72 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  49.12 
 
 		 295 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  47.37 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  42.32 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  47.89 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  45.42 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  45.45 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  47.22 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  41.47 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  42.37 
 
 		 286 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  50.94 
 
 		 304 aa  222  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  46.43 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  46.43 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  47.94 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  46.28 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  40.26 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40 
 
 		 290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  42.27 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  41.4 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  39.65 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  40.79 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  46.95 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  42.4 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  43.34 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  45.22 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  42.86 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  46.78 
 
 		 290 aa  215  9e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>