More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4173 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 316 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  71.81 
 
 		 307 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  69.28 
 
 		 320 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  69.31 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  68.79 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  68.79 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  62 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  65.19 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  59.86 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  58.92 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  59.52 
 
 		 299 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  58.31 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  54.6 
 
 		 337 aa  340  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  57.97 
 
 		 300 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  58.31 
 
 		 300 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  56.76 
 
 		 299 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  57.29 
 
 		 300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  59.73 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  59.73 
 
 		 296 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  51.88 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 295 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 295 aa  301  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 297 aa  282  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  50.69 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  52.17 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  52.19 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  48.31 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  49.65 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  51.18 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  52.04 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  48.47 
 
 		 294 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  49.49 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  45.51 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  49.32 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  47.94 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  49.07 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  45.17 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  47.78 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.41 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  42.81 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.62 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  43.96 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.99 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  49.63 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  49.82 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  48.08 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  47.6 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  48.88 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  49.82 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  42.77 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  44.95 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.51 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  44.71 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  46.6 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  46.1 
 
 		 295 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  43.29 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  45.55 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  46.45 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  44.82 
 
 		 295 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  41.33 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  44.14 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  45.12 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  45.12 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  45.12 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  46.8 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  45.12 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  45.12 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  45.12 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  45.12 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  45.2 
 
 		 294 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  45.2 
 
 		 294 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  45.2 
 
 		 294 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  45.55 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  45.2 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  43.24 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  50.67 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  45.2 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  45.92 
 
 		 311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  43.54 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 295 aa  215  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  41.78 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>