More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0152 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  78.64 
 
 
307 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  66.67 
 
 
309 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  70.17 
 
 
320 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  68.79 
 
 
316 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  64.97 
 
 
301 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  58.42 
 
 
312 aa  362  4e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  57.67 
 
 
300 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  57.14 
 
 
300 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  57.82 
 
 
299 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  58.84 
 
 
300 aa  344  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  58.45 
 
 
306 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  56.52 
 
 
299 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  58.42 
 
 
300 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  55.23 
 
 
337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  56.19 
 
 
299 aa  338  5e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  55.25 
 
 
295 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  59.46 
 
 
296 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  54.92 
 
 
295 aa  322  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  59.12 
 
 
296 aa  317  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 
296 aa  299  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  53.82 
 
 
297 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  52.86 
 
 
297 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  51.03 
 
 
294 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  48.44 
 
 
294 aa  287  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  49.83 
 
 
294 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  51.16 
 
 
297 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 
295 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  51.85 
 
 
297 aa  281  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  48.46 
 
 
297 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 
297 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  48.3 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  45.64 
 
 
297 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  49.66 
 
 
296 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  46.55 
 
 
295 aa  252  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 
294 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.26 
 
 
315 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  47.42 
 
 
296 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  48.67 
 
 
297 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.39 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  51.89 
 
 
290 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  49.83 
 
 
295 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  49.83 
 
 
295 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  45.3 
 
 
296 aa  235  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  45.3 
 
 
296 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  46.82 
 
 
299 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  44.63 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  44.63 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  43.23 
 
 
335 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  47.8 
 
 
295 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  44.75 
 
 
297 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  42.95 
 
 
306 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  45.99 
 
 
294 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 
299 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  46.45 
 
 
299 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  48.46 
 
 
290 aa  227  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  43.88 
 
 
297 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  44.3 
 
 
296 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  44.3 
 
 
296 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  44.3 
 
 
296 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  44.3 
 
 
296 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  44.3 
 
 
296 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  44.81 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  40.96 
 
 
334 aa  225  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  48.48 
 
 
295 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  45.92 
 
 
297 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  43.16 
 
 
293 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  47 
 
 
295 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  51.5 
 
 
304 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.73 
 
 
297 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  46.49 
 
 
305 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  48.31 
 
 
295 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 
327 aa  222  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.02 
 
 
306 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  42.47 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  43.51 
 
 
318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.84 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  48.48 
 
 
295 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  46.8 
 
 
295 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 
286 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  49.08 
 
 
310 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  45.74 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  45.74 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  41.86 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  46.34 
 
 
298 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 
295 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  47.81 
 
 
295 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  45.79 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  46.98 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.99 
 
 
293 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  45.45 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  43.3 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40.36 
 
 
290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 
337 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  44.11 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  46.1 
 
 
300 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  41.29 
 
 
290 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  45.27 
 
 
305 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>