More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0098 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 285 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  54.95 
 
 		 299 aa  294  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  56.75 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  58.56 
 
 		 299 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  52.82 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  52.63 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  52.78 
 
 		 291 aa  271  6e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  61.94 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  55.28 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  49.48 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  52.43 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  55.51 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  53.31 
 
 		 293 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  61.6 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  57.39 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  53.31 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  53.31 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  61.22 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  53.31 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  51.22 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  58.89 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  58.89 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  51.04 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  61.65 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  53.31 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  52.41 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  56.29 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  51.38 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  57.84 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  57.14 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  49.13 
 
 		 298 aa  262  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  53.82 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  53.11 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  53.82 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  57.25 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  58.94 
 
 		 299 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  58.94 
 
 		 299 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  58.94 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  58.94 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  58.94 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  58.94 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  58.94 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  59.09 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  59.09 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  59.09 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  54.67 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  59.09 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  59.09 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  58.56 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  55.43 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  55.48 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  55.48 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  54.2 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  54.2 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  54.55 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  54.2 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  53.85 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  54.67 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  54.29 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  51.58 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  53.85 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  53.85 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  53.85 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  53.85 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  53.52 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  56.18 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  54.14 
 
 		 300 aa  251  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  53.5 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  53.5 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  53.5 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  55.71 
 
 		 306 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  54.98 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  53.5 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  54.98 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  55.59 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  56.84 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  54.64 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  57.54 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  53.85 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  60.46 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  57.93 
 
 		 303 aa  244  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  57.14 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  54.51 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  53.36 
 
 		 296 aa  241  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  51.05 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  54.74 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  47.89 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  48.59 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  60.46 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  54.39 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  50.17 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  52.4 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  54.06 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  53.99 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  53.31 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  50.71 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  53.31 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  51.72 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>