More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1049 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 294 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  56.31 
 
 		 295 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  55.97 
 
 		 295 aa  315  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  55.22 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  52.05 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  54.3 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  55.25 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  54.92 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  51.37 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  53.9 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  48.3 
 
 		 294 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  51.86 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  52.2 
 
 		 296 aa  271  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  52.88 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.41 
 
 		 299 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  52.46 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  47.14 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 300 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  48.11 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  48.47 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  47.12 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  46.96 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  47.8 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  47.3 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  48.98 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  51.03 
 
 		 296 aa  254  9e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.34 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  45.08 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  45.27 
 
 		 295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.21 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  48.58 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  48.96 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  52.2 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  45.91 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  52.48 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  47.7 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  48.24 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  47.7 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  49.11 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  48.39 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.12 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  44.9 
 
 		 297 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  48.47 
 
 		 290 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  47.7 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  48.4 
 
 		 308 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  43.05 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  47.33 
 
 		 308 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  49.83 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.58 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  48.39 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  45.58 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.12 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  45.21 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  45.17 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  46.23 
 
 		 302 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  44.75 
 
 		 306 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  47.58 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.28 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  49.5 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  49.5 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  45.05 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  49.16 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  48.83 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  47.33 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  48.3 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  50.18 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  51.06 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  51.06 
 
 		 295 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  52.13 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  51.3 
 
 		 303 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  49.62 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  48.11 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  43.84 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  48.29 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  51.3 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  45.08 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  47.57 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.37 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  48.14 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  47.96 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  49.82 
 
 		 302 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>