More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004257 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  90.48 
 
 		 294 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  78.91 
 
 		 294 aa  471  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  66.33 
 
 		 298 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  57.97 
 
 		 299 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  62.63 
 
 		 306 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  59.45 
 
 		 293 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  62.63 
 
 		 306 aa  341  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  62.29 
 
 		 306 aa  338  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  60.54 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  58.64 
 
 		 293 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  61.54 
 
 		 299 aa  332  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  57.14 
 
 		 293 aa  332  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  60.75 
 
 		 299 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  58.04 
 
 		 293 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  60.75 
 
 		 299 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  60.75 
 
 		 299 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  60.41 
 
 		 299 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  57 
 
 		 293 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  59.18 
 
 		 303 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  60.41 
 
 		 299 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  57.69 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  57.69 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  57.68 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  57.69 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  60.14 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  58.31 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  58.31 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  58.31 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  58.31 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  58.31 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  58.31 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  58.31 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  58.31 
 
 		 299 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  57.44 
 
 		 293 aa  322  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  57.34 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  60.07 
 
 		 306 aa  318  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  58.84 
 
 		 303 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  56.61 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  58.7 
 
 		 296 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  57.79 
 
 		 293 aa  301  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  57.79 
 
 		 293 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  55.25 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  57.79 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  51.7 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  55.97 
 
 		 293 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.19 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  53.61 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  52.76 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  49.5 
 
 		 304 aa  279  5e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  52 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  49.31 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  49.33 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  52.04 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  51.02 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  51.02 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  49.3 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  52.38 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  49.32 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 295 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  48.82 
 
 		 300 aa  248  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  48.64 
 
 		 291 aa  248  8e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  46.31 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  52.17 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  48.64 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  47.99 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  47.99 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  48.98 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  49.48 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  48.64 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  44.52 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  47.62 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  48.65 
 
 		 298 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  48.31 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  45.49 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  48.07 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  44.03 
 
 		 294 aa  231  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  43.49 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1388  polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.59 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  47.58 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  48.91 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  41.16 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  42.41 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>