More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0841 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  47.3 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  43.73 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  43.54 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  47.44 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  43.54 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  47.1 
 
 		 300 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  43.58 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  46.42 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  45.55 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  47.1 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  44.64 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  45.21 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.08 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  45.74 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  44.26 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  45.39 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  42.36 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.93 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  48.13 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  42.37 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  46.53 
 
 		 290 aa  221  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  45.23 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  43.17 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  39.8 
 
 		 315 aa  218  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 296 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  41.97 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  45.3 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  40 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  41.95 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  46.08 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  46.08 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  46.08 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  46.08 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  46.08 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  40.68 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  40.96 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 296 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 296 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  46.08 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.42 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  41.34 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  38.81 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  46.42 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  43.62 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  40.36 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  43.43 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  40.64 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  46.26 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  37.54 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  44.81 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  44.84 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  42.95 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.39 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  43.62 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  43.99 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  44.07 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  43.05 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  43.56 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  42.47 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  39.64 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  39.55 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  35.49 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  38.31 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  39.93 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  40.99 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  39.51 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  41.02 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  37.72 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3822  polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50228  normal  0.255559 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  40 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  38.87 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  37.58 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  39.93 
 
 		 296 aa  185  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>