More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1916 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 294 aa  590  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.3 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.3 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  47.14 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  48.08 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.15 
 
 		 299 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  47.39 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  48.28 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  47.74 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  47.04 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.43 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  46.52 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  43.05 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  45.99 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  45.99 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  41.16 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  45.26 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  44 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  43.1 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  45.79 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  45.35 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  43.54 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.01 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  41.89 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  44.53 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  39.86 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  43.18 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  43.18 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  40.27 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  43 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  42.8 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  44.78 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  40.88 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  49.81 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  39.86 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  42.71 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  43.15 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.85 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  43 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  43.81 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  43.81 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  43.81 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  43.81 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  43.81 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  43.81 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  40.33 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  43.02 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  43.02 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  43.48 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  45.53 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  43.14 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  43.14 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  43.48 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  40.94 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 320 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  43.14 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  43.14 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  43.14 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  45.8 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  43.51 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  39.32 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.87 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  40.8 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  38.46 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  42.42 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  45.9 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  44.56 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  44.56 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  45.52 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  38.72 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  38.73 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  45.9 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  38.18 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.18 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  38.38 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  38.38 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  38.38 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  48.65 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  42.35 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  38.38 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  39.26 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  38.05 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  38.38 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>