More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2176 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  79.46 
 
 		 297 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  73.74 
 
 		 295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  73.74 
 
 		 295 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  79.12 
 
 		 297 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  76.35 
 
 		 297 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  74.41 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  69.15 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  57.58 
 
 		 296 aa  344  8e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  55.59 
 
 		 294 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  56.95 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  54.58 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  56.42 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  54.52 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  57.14 
 
 		 300 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  56.12 
 
 		 299 aa  315  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  56.8 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  52.03 
 
 		 297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  56.46 
 
 		 300 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  54.92 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  51.85 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  51.85 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  54.73 
 
 		 299 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  54.39 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  52.19 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  51.19 
 
 		 320 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  53.22 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  51.01 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  52.88 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  57.29 
 
 		 296 aa  291  9e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  52.54 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  55.93 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  52.46 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  49.83 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  47.78 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  51.64 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  52.17 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  48.65 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.24 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  45.64 
 
 		 337 aa  265  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  48.47 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.54 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  45.23 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  45.58 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  49.16 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  54.48 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  51.68 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  51.51 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  51.19 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  51.68 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  54.1 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  51.22 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  50.87 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  51.56 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  51.7 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  46.98 
 
 		 296 aa  241  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  48 
 
 		 318 aa  238  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  43.58 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  43.24 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  51.18 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  47.96 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  47.96 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  43.82 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  51.15 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  45.27 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  47.21 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  48.64 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  47.95 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  47.3 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  42.3 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  45.79 
 
 		 290 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  42.81 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  50.84 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.55 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.28 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  47.8 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  47.8 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  47.8 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  42.57 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  47.8 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  47.8 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  43.93 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  45.79 
 
 		 291 aa  221  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  46.26 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  42.86 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  47.62 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>