More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1926 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  91.89 
 
 		 296 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  85.47 
 
 		 306 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  83.33 
 
 		 299 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  82.99 
 
 		 299 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  79.59 
 
 		 300 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  77.74 
 
 		 299 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  78.35 
 
 		 300 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  78.35 
 
 		 300 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  78.35 
 
 		 300 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  66.33 
 
 		 301 aa  378  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  62.54 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  60.48 
 
 		 307 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  59.46 
 
 		 309 aa  347  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  59.46 
 
 		 309 aa  347  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  59.8 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  57.72 
 
 		 312 aa  345  4e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  59.73 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  58.25 
 
 		 337 aa  330  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  56.31 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  57.14 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  52.72 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  57.29 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  56.61 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  54.18 
 
 		 297 aa  285  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  56.57 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  51.03 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 294 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  51.03 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  55.1 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  50.92 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  50.85 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  48.5 
 
 		 315 aa  265  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  53.16 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  51.19 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  46.6 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.64 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  48.46 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  48.42 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  49.48 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  49.66 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  52.29 
 
 		 290 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  51.19 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  49.33 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  48.11 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  49.66 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  45.27 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  45.05 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  44.08 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  50.66 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  47.42 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  47.95 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  48.5 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  47.62 
 
 		 302 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  47.6 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  49.82 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  47.44 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  46.23 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  48.13 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  48.13 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  46.23 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  46.23 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  48.46 
 
 		 294 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  51.77 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.79 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  45.42 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  47.26 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  46.91 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  46.76 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  42.65 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  50.22 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.75 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  46.23 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  46.23 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  46.23 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  46.23 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  46.23 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  50.17 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>