More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2320 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 297 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  73.4 
 
 		 297 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  61.86 
 
 		 296 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  61.86 
 
 		 296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  60.82 
 
 		 296 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  60.82 
 
 		 296 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  60.94 
 
 		 297 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  60.82 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  60.82 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  60.82 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  60.82 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  60.82 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  59.6 
 
 		 297 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  47.64 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  47.64 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 300 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  47.14 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  48.44 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  52.06 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  47.81 
 
 		 301 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  47.85 
 
 		 307 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.02 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 320 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  46.76 
 
 		 295 aa  258  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.86 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  45.64 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  51.5 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  47.43 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  45.64 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  51.5 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  45.7 
 
 		 299 aa  254  8e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  45.7 
 
 		 299 aa  254  9e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  45.51 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  51.74 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  50.36 
 
 		 290 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  47.06 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  47.67 
 
 		 312 aa  247  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  48.26 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  48.73 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  50.72 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  47.75 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  47.29 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  43.92 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.9 
 
 		 294 aa  235  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  48.47 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  52.34 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  43.73 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.94 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  46.6 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  46.64 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  45.69 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  49.24 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  45.08 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  46.56 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  42.96 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  46.83 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  46.56 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  46.1 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  44.86 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  44.92 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  44.92 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  42.47 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  51.29 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.45 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  44.28 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  44.3 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  47.33 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.96 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  43.69 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  43.7 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  42.05 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  39.46 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  43.06 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  49.56 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  48.22 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  45.95 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  49.22 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  47.2 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  44.24 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  41.99 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  39.66 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  47.2 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  43.32 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  39.53 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.45 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  43.08 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  40.68 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>