More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0125 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0125  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.503907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  69.01 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  65.59 
 
 		 304 aa  338  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  59.42 
 
 		 298 aa  325  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  54.19 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  47.69 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  54.28 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  48.39 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.98 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  47.25 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  45.13 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  45.13 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  46.73 
 
 		 295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  42.35 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  46.25 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  45.36 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.93 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  46.91 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  43.38 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.49 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  48.57 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  43.32 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  42.81 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  44.66 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  48.07 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  46.79 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.79 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  47.3 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  45.19 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  47.57 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.66 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  44.56 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  41.55 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  46.43 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  47.57 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  44.83 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  48.12 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  49.47 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  41.2 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46.07 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  47.88 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  44.83 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  43.97 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  38.03 
 
 		 299 aa  222  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.43 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  44.86 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  43.91 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.6 
 
 		 297 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.38 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1774  Polyprenyl synthetase  43.83 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  46.1 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  45.25 
 
 		 290 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  42.35 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  39.81 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  44.2 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  45.23 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  40.26 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.18 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  42.14 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  44.88 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  41.79 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  41.79 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  41.79 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.79 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  43.64 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  43.64 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  44.88 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  42.57 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  41.43 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  42.57 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  44.98 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  44.98 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  41.07 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 291 aa  206  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  44.8 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  46.2 
 
 		 309 aa  205  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  46.08 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  43.19 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.5 
 
 		 296 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  45.42 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  45.77 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  43.77 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  40.58 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  41.25 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  44.64 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  42.24 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  42.24 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  42.24 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  46.8 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  42.55 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  42.9 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.4 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>