More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0818 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 309 aa  595  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  77.63 
 
 		 310 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  58.55 
 
 		 337 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  55.66 
 
 		 307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  56.95 
 
 		 308 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  56.62 
 
 		 308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  54.52 
 
 		 321 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  55.63 
 
 		 308 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  53.87 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  54.52 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  60.33 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  60.33 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  59.93 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  55.35 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  51.16 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  55.88 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  62.59 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  59.34 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  55.05 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  54.3 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  54.3 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  56.21 
 
 		 301 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  55.52 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  55.78 
 
 		 304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  55.15 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  51.63 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  47.16 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  48.69 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4337  geranyltranstransferase  55.75 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  45.22 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.33 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  44.7 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  49.45 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.11 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.11 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  43.71 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  44.88 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  46 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  48.2 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  51.47 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  42.9 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  46.5 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  38.05 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  43 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.73 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  50.51 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.16 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  47.33 
 
 		 327 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  47.37 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  47.56 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  48.18 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  41.2 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.9 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  46.05 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  47.23 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.56 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  48.99 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  48.18 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  48.18 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  47 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  48.18 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  48.18 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  44.22 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  46.03 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  47.02 
 
 		 294 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  48.39 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  48.18 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  48.18 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  48.18 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  40.6 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  43.09 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  41.97 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 294 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  40.26 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  43.44 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  46.36 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  45.61 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  46.99 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  42.96 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  43.94 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  46.99 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  46.99 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  46.99 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1135  farnesyl-diphosphate synthase  49.5 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  44.26 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  45.68 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2194  polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>