More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1198 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 301 aa  596  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  61.05 
 
 		 305 aa  345  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  61.99 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  54.03 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  59.6 
 
 		 302 aa  295  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  55.89 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  52.52 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  52.78 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  49.68 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  53.95 
 
 		 310 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  51.44 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  53.5 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  53.14 
 
 		 337 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  52.52 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  48.7 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  48.03 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  51.55 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2194  polyprenyl synthetase  55.56 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  48.01 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  55.63 
 
 		 297 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  49.65 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  48.97 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  55.35 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  47.9 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  52.6 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  52.6 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  54.61 
 
 		 323 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  48.42 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  53.63 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  50.7 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  51.69 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  53.72 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  53.63 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  44.67 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.5 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  44.41 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.07 
 
 		 295 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  51.31 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  47.5 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  46.83 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40.56 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.09 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.52 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  43.42 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  47.39 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  41.92 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0399  polyprenyl synthetase  53.48 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  46.04 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  52.88 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  41.3 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  46.9 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  46.55 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  39.46 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  46.24 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  47.52 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  48.9 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  43.54 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.58 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1135  farnesyl-diphosphate synthase  52.54 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  41.64 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  41.24 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  41.24 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  41.24 
 
 		 293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.77 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  44.91 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  46.55 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  44.91 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  48.4 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0089  farnesyl-diphosphate synthase  54.92 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  49.64 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  47.9 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.87 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  48.3 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  40.67 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  48.3 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  46.96 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  43.86 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.86 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  45.71 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  40.89 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  45.71 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  41.14 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  41.14 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>