More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1712 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  100 
 
 
304 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  99.34 
 
 
304 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  87.5 
 
 
304 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  71.48 
 
 
305 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  67.34 
 
 
304 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  57.72 
 
 
300 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  67.68 
 
 
304 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  67.34 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4337  geranyltranstransferase  70.21 
 
 
283 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  54.82 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  53.82 
 
 
307 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  55.15 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  54.79 
 
 
308 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  53.16 
 
 
321 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  53 
 
 
308 aa  295  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  54.33 
 
 
308 aa  295  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  55.3 
 
 
310 aa  285  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  52.32 
 
 
337 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  59.35 
 
 
308 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  54.3 
 
 
309 aa  275  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  56.1 
 
 
290 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  53.82 
 
 
320 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  53.82 
 
 
320 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  51.49 
 
 
305 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  53.31 
 
 
323 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  54.82 
 
 
320 aa  245  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  46.23 
 
 
303 aa  242  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  56.44 
 
 
302 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.52 
 
 
309 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.52 
 
 
309 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  47.29 
 
 
293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  49.12 
 
 
293 aa  231  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  47.21 
 
 
315 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  46.21 
 
 
293 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  48.87 
 
 
292 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  42.81 
 
 
294 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  47.17 
 
 
293 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  45.21 
 
 
300 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  48.68 
 
 
293 aa  228  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  48.46 
 
 
311 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.74 
 
 
301 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 
293 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  45.85 
 
 
293 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 
293 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 
293 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  46.01 
 
 
293 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  47.49 
 
 
295 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  46.21 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  45.63 
 
 
293 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  51.31 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  42.23 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 
295 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 
295 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  40.59 
 
 
309 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.59 
 
 
297 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  45.49 
 
 
291 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  39.67 
 
 
316 aa  215  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45 
 
 
294 aa  215  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 
293 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.55 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  40.66 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.22 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  46.32 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  48.01 
 
 
293 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.79 
 
 
295 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  47.46 
 
 
294 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  48.87 
 
 
291 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 
327 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  46.1 
 
 
304 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  40.8 
 
 
320 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  47.65 
 
 
293 aa  208  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 
300 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 
294 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  46.07 
 
 
295 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  43.12 
 
 
298 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  46.79 
 
 
295 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  42.95 
 
 
297 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 
300 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.72 
 
 
306 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 
294 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.44 
 
 
295 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  46.75 
 
 
298 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  47.91 
 
 
293 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  39.53 
 
 
294 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  40.94 
 
 
297 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.53 
 
 
299 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.24 
 
 
297 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.2 
 
 
300 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0399  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 
287 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  48.5 
 
 
289 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  44 
 
 
306 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 
285 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  41.11 
 
 
312 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  40.08 
 
 
294 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  44.32 
 
 
299 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  40.94 
 
 
295 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  46.67 
 
 
294 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  46.67 
 
 
294 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.235577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>