More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1126 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 304 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  87.5 
 
 		 304 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  87.5 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  71.05 
 
 		 305 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  58.92 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  65.22 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  67 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  66.67 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4337  geranyltranstransferase  69.86 
 
 		 283 aa  318  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  55.3 
 
 		 308 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  55.63 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  54.97 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  55.63 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  56.11 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  55.96 
 
 		 308 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  53.49 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  56.72 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  52.94 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  60.79 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  55.05 
 
 		 309 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  55.63 
 
 		 320 aa  271  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  55.63 
 
 		 320 aa  271  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  56.79 
 
 		 290 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  52.4 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  55.96 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  53.29 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  50.76 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  53.49 
 
 		 302 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  46.85 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  48.49 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  48.29 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  46.93 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.24 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  45.73 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  46 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  45.91 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  49.24 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  51.53 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  43.04 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  43.04 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  50.7 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  46.77 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.32 
 
 		 294 aa  225  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  47.31 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  47.55 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.32 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  40.66 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.57 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  47.2 
 
 		 293 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  43.89 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.19 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  46.15 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  46.85 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  54.55 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.69 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  45.08 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  46.3 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.79 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  45.25 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  45.16 
 
 		 295 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  53.05 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  40.35 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1135  farnesyl-diphosphate synthase  54.96 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  54.58 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  44.32 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  48.86 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  42.64 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  40.27 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.45 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.28 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  44.36 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  39 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  44.4 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.31 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  43.94 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  40.43 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  40.4 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  46.39 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  48.04 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  44.7 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3295  geranyltranstransferase  54.04 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  44.81 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  45.88 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  45.29 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>