More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3429 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 305 aa  600  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  71.05 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  71.71 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  71.71 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  68.24 
 
 		 304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  56.27 
 
 		 300 aa  325  8.000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  66.33 
 
 		 304 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4337  geranyltranstransferase  70.57 
 
 		 283 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  65.66 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  53 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  51.01 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  51.34 
 
 		 308 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 310 aa  272  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  52.01 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  51.34 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  48.69 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  51.47 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  51.34 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  50.16 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  57.4 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  56.99 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  47.25 
 
 		 305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  52.33 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  54.05 
 
 		 302 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  48.47 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  46.15 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  49.62 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  43.71 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  47.73 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.92 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  40.91 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  40.91 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 291 aa  215  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  42.76 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.44 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  44.93 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  44.2 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  50.19 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  50.37 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  40.98 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  40.14 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  44.64 
 
 		 293 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  45.21 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  43.23 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  43.84 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  39.87 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0399  polyprenyl synthetase  50.93 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.96 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  39.2 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.39 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  48.5 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.21 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  42.36 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.45 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  43.43 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  43.43 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  39.02 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  51.07 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  47.81 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  42.38 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  42.76 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  42.76 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  43.04 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  49.62 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  42.76 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  43.1 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  42.76 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  42.05 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.2 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  43.45 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  40.53 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  42.76 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  42.76 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  40.45 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  42.76 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  40.14 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  43.68 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.44 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  40.82 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  42.76 
 
 		 293 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  43.1 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2194  polyprenyl synthetase  50.57 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  45.65 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  51.07 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.73 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.64 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>