More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1678 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  45.61 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  43.42 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  42.39 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  42.43 
 
 		 297 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  43.67 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  41.45 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.52 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  43.11 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  41.41 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.19 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  41.91 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.71 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  44 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  42.28 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.14 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  42.39 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  42.48 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  44.6 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  42.45 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.05 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  43.19 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  44.96 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  41.39 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.88 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  44.84 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  48.75 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.72 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  38.57 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  41.5 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  43.53 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  42.86 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  38.98 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  42.61 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.32 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  44.8 
 
 		 295 aa  188  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  44.12 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  42.96 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.73 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  39.61 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  40.2 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  43.53 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  40.48 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  44.2 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  43.87 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  45.09 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  42.14 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  41.18 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  41.18 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  43.61 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  41.18 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  41.18 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  43.84 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  41.88 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  44.08 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  41.92 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  44.08 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  41.18 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  41.18 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  43.53 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  41.18 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  39.87 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  41.52 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  39.86 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  42.46 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  40.93 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  41.16 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  41.44 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  46.21 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  43.53 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  46.69 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  40.77 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  43.07 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  43.88 
 
 		 296 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  44.52 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  44.44 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  43.75 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  45.65 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>