More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6645 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 290 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  90.34 
 
 		 337 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  82.07 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  78.55 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  78.55 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  78.89 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  67.74 
 
 		 308 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  56.21 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  59.45 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  55.86 
 
 		 321 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  53.98 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  59.93 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  54.14 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  55.17 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  54.48 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  54.48 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  56.79 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  50.18 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  56.45 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  52.61 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  56.1 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  53.73 
 
 		 311 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  50.56 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  55.35 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  55.86 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  53.79 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.79 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  50.36 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  48.16 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  55.86 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.49 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4337  geranyltranstransferase  60 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  56.93 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  58.43 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1135  farnesyl-diphosphate synthase  58.43 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  47.45 
 
 		 300 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  56.99 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  54.83 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  43.17 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  48.33 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  45.35 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  47.22 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  45.1 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  44.03 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.32 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.32 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  44.69 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  47.96 
 
 		 291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  45.64 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  45.9 
 
 		 295 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  44.61 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.28 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  46.47 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  49.08 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  48.11 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  45.96 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  43.87 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.29 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  45.63 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  42.51 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  42.51 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  44.06 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  42.01 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  48.4 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  48 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  44.57 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  45.79 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  51.11 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  43.66 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  40.62 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  46.55 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.42 
 
 		 295 aa  201  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.33 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  51.25 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  51.25 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  45.71 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  47.9 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.29 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  43.87 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  47.84 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>