More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0848 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 295 aa  591  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  61.82 
 
 		 294 aa  330  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  52.31 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  55.97 
 
 		 302 aa  281  6.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  51.59 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  48.68 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  53.38 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  47.33 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  47.33 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  47.33 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  48.69 
 
 		 309 aa  244  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  45.39 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  48.84 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  43.88 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  48.49 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  46.33 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.87 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  45.03 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 300 aa  234  9e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.25 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  46 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2194  polyprenyl synthetase  52.46 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  47.83 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  41.84 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.05 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40.21 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  45.58 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  45.24 
 
 		 293 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  41.84 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  47.49 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  46.78 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  41.24 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  46.26 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  51.59 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.81 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  40.48 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.91 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  46.07 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  44.97 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  44.97 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  44.97 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  46.1 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  43.15 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  44.97 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  40.42 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  45.8 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  41.46 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  44.97 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  44.97 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  44.97 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  44.69 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  45.76 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  44.71 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  45.2 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  42.03 
 
 		 296 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  45.2 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  45.2 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  46.36 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  46.36 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  39.66 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  40.55 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  47.22 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  42.6 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  42.71 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  42.71 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  46.37 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  43.32 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  43.94 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  38.52 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0399  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  38.06 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  40.34 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  47.49 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  38.62 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  42.09 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  43.33 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  45.3 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  40.86 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  43.38 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  46.15 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  48.48 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  39.24 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>