More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3315 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  61.82 
 
 		 295 aa  332  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  56.03 
 
 		 305 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  56.8 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  46.76 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  53.55 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  48.51 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  48.51 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  49.34 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  48.5 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  49.29 
 
 		 300 aa  238  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  47.52 
 
 		 321 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  47.52 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  45.21 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  48.2 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  47.52 
 
 		 310 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  51.71 
 
 		 297 aa  222  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.81 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  48.03 
 
 		 297 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  45.68 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  50.9 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  45.35 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  47.8 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  46.62 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  45.92 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  46.24 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  46.24 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  46.24 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  45.35 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  46.24 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  45.42 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  47.46 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  45.77 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  45.24 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  45.24 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  45.24 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.59 
 
 		 294 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  48.23 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2194  polyprenyl synthetase  49.47 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  41.89 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  45.76 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.66 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  47.02 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  40.21 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  47.02 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  40.86 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  48.91 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  47.19 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  43.92 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  44.32 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  43.94 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  46.74 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  45.28 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  46.55 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  43.88 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  43.88 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  47.76 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.88 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  43.2 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.54 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.07 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  47.02 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  43.93 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  43.93 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  43.93 
 
 		 322 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  46.39 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  47.67 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  47.12 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  40.88 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.68 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  47.37 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  43.77 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  41.43 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  40.82 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  39.73 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  45.63 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  44.87 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  39.86 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  44.49 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  46.59 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  43.21 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  45.64 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  46.82 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>