More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0780 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 302 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  61.99 
 
 		 305 aa  348  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  56.51 
 
 		 303 aa  322  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  57 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  55.97 
 
 		 295 aa  291  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  52.77 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  51.79 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  59.6 
 
 		 301 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  54.3 
 
 		 311 aa  281  8.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  53.96 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  54.14 
 
 		 307 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  52.44 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  51.84 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  52 
 
 		 308 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  60.28 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  52.46 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  54.03 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  48.3 
 
 		 300 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  51.63 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  47.65 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  49.82 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  56.44 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  56.44 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2194  polyprenyl synthetase  55.79 
 
 		 306 aa  248  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  56.89 
 
 		 308 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.65 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  44.18 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  53.44 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  53.79 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.36 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  55.93 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  46.07 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  48.23 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  45.2 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.39 
 
 		 295 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  52.48 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  51.48 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  51.48 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  46.69 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 293 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.68 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.16 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  44.71 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.9 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  44.48 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  44.84 
 
 		 293 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  47.77 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  47.77 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  47.77 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  47.77 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  51.49 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  43.43 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  47.77 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  47.77 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  47.77 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  47.77 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  45.89 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  46.8 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  56.8 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  46.28 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  47.16 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  41.16 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1135  farnesyl-diphosphate synthase  56.61 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  46.39 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  42.38 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  51.21 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  48.09 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  51.15 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  47.42 
 
 		 294 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  41.9 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  48.28 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.14 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  50.17 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  54.24 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  50.17 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  48.26 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  47.86 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  41.99 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  40.86 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  42.16 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  42.16 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  42.16 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0089  farnesyl-diphosphate synthase  51.37 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41.44 
 
 		 299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  41.72 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0399  polyprenyl synthetase  50.35 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>