More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0612 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0612  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 323 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  77.4 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  85.17 
 
 		 320 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  85.17 
 
 		 320 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2457  Polyprenyl synthetase  84.86 
 
 		 320 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  82.07 
 
 		 290 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  55.52 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  53.59 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  53.27 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  53.55 
 
 		 308 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  52.63 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  52.29 
 
 		 307 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  55.88 
 
 		 309 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  53.59 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0205  polyprenyl synthetase  60.93 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0937506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  52.96 
 
 		 308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  53.29 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  51.49 
 
 		 305 aa  265  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  53.64 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  53.31 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  46.84 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  53.44 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  54.61 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  48.31 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3122  polyprenyl synthetase  52.48 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  47.19 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  47.35 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  49.45 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  45.1 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4337  geranyltranstransferase  56.25 
 
 		 283 aa  222  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.45 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  46.32 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  54.89 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  50.33 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.49 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.16 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4157  Polyprenyl synthetase  51.5 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  42.54 
 
 		 293 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.57 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  51.32 
 
 		 289 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  42.54 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3429  farnesyl-diphosphate synthase  52.33 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  42.65 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1135  farnesyl-diphosphate synthase  51.5 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  47.19 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3829  Polyprenyl synthetase  51.16 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  45.13 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  41 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  41 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 295 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  44.36 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.14 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  43.87 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  41.64 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  39.61 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  39.35 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  41.23 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  41.42 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  42.16 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  46.18 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  45.36 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  45.05 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  41.76 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.01 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  41.76 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  38.99 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  44.32 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  42.95 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  42.72 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  43.68 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  43.84 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  43.09 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  44.8 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  43.01 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  46.93 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.85 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  38.69 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  42.74 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  40.51 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  37.33 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  41.33 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  46.18 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  46.37 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  46.18 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  47.31 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>