More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2194 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2194  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  67.22 
 
 		 303 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  55.44 
 
 		 305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0022  farnesyl-diphosphate synthase  65.65 
 
 		 297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0780  polyprenyl synthetase  55.79 
 
 		 302 aa  258  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175929  normal  0.724613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1198  polyprenyl synthetase  55.56 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.805389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0848  farnesyl-diphosphate synthase  52.46 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.840697  normal  0.407344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  49 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  43.86 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.28 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  44.97 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  48.8 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  49.43 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3315  polyprenyl synthetase  49.47 
 
 		 294 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  45.16 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  50.18 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.6 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  46.03 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  49.31 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  51.33 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.68 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.68 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  49.04 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0399  polyprenyl synthetase  51.22 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  47.91 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  45.21 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  44.67 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.29 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  40.55 
 
 		 293 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.37 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1712  geranyltranstransferase  50.95 
 
 		 304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  41.5 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.05 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  40.55 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  48.81 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  46.29 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  46.74 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.49 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  51.88 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  43.1 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2791  polyprenyl synthetase  52.83 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0405242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  44.24 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  47.99 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  44.6 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  44.6 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  42.05 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  46.52 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.94 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  47.43 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  44.2 
 
 		 290 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1135  farnesyl-diphosphate synthase  53.96 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2796  polyprenyl synthetase  52.48 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6645  polyprenyl synthetase  52.04 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  42.32 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  48.81 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  48.81 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  41 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  47.92 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.97 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  42.71 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2752  Polyprenyl synthetase  47.16 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.882711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2529  polyprenyl synthetase  47.16 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  47.92 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  47.44 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.2 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  48.18 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  45.24 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  47.2 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.56 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  42.76 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  46.76 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  46.32 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  44.74 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  46.32 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.51 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  43.86 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  44.74 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  46.24 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>