More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3491 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  48.14 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  52.88 
 
 		 295 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  52.2 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  50.68 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  50.35 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  50.35 
 
 		 300 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  50.36 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  49.65 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  51.53 
 
 		 307 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  47.08 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  47.92 
 
 		 320 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  48.16 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  52.43 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  51.31 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  51.89 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  51.89 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  50.94 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  53.91 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  47.64 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  48.47 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  51.72 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  49.06 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  51.47 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  47.3 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  52.22 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  46.26 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  48.31 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  49.16 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  49.49 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  49.43 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  48.08 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 297 aa  236  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  49.13 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  49.13 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  48.97 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  47.58 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  48.4 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  51.26 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  48.62 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  48.62 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  48.62 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  48.62 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  48.62 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  47.57 
 
 		 337 aa  229  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  52.29 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  45.05 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  48.68 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  48.08 
 
 		 297 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  48.68 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  49.81 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.63 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45.91 
 
 		 294 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.83 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  42.12 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  41.44 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  42.12 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  42.12 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.15 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  48.48 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  48.44 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  47.71 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  50.38 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  46.26 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  43.33 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  46.3 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  50.9 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  42.12 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  39.5 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  47.53 
 
 		 299 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  51.71 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  44.8 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  47.71 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  48.14 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  41.44 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  45.93 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  50.73 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  47.95 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  50.75 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  44.27 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  43.06 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  44.95 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  43.77 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  51.15 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  42.03 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  51.32 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  48.29 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>