More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1759 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1759  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 292 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  58.84 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0942  Polyprenyl synthetase  59.64 
 
 		 295 aa  298  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  59.31 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  51.37 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  54.45 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  46.1 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0125  Polyprenyl synthetase  54.28 
 
 		 313 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.503907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  51.76 
 
 		 294 aa  258  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  46.71 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  46.71 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  43.99 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  46.21 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 299 aa  251  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.52 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.95 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  43.54 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  45.99 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  45.52 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  48.45 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  46.43 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  43.73 
 
 		 309 aa  244  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  45.07 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  45.89 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  47 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  44.97 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  47.62 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  42.47 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  44.57 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  49.83 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  49.47 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  45.1 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  43.96 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  45.61 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  49.44 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  43.82 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  43.54 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.29 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.35 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  47.35 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  47.01 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  47.39 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0841  Polyprenyl synthetase  43.99 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  45.67 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  47.39 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  44.98 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  46.27 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  47.86 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  46.27 
 
 		 296 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  46.27 
 
 		 296 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  47.12 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  46.23 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  44.93 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  42.76 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  44.72 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  43.69 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  43.69 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  43.69 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  43.69 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  43.69 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  46.46 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0495  polyprenyl synthetase  45.48 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  42.37 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  45.09 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  46.92 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  42.23 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  48.71 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  47.57 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  44.6 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  48.71 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  48.71 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  48.71 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  47.79 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  42.76 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  39.87 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  43.15 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  45.36 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  43.24 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  42.37 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.49 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  46.34 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  41.99 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  46.34 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  46.34 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  47.37 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  42.95 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  44.72 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>