More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2818 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 337 aa  675    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  40.7 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  41.23 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  30.98 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  34.02 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  38.31 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  37.61 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  39.02 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  37.69 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  34.03 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  29.34 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  29.72 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.72 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  38.49 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  35.85 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  35.29 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  35.77 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  41.63 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.93 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  28.34 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  37.24 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  27.65 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  35.4 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  38.12 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  33.47 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  33.75 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  31.58 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  35.24 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  31.34 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  36.67 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.86 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  38.05 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  36 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  35 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  35.62 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  36.67 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.45 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  31.77 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.65 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  32.6 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.88 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  30.54 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.38 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  32.54 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.53 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  37.04 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.79 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.27 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  36.19 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  36.82 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  39.75 
 
 		 346 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  37.27 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  34.42 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.79 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  38.62 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  32.45 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  31.82 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  40.57 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  33.94 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.78 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.9 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  36.43 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2253  farnesyl-diphosphate synthase  36.44 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0847122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  33.46 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  31.42 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.21 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  33.95 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.58 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  30.97 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  34.72 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  33.81 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  33.58 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  36.61 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  35.74 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  33.08 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  32.86 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  30.91 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  34.19 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  35.21 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0787  polyprenyl synthetase  35.29 
 
 		 272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.491944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  32.85 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  32.85 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>