More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4971 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 346 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  57.88 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  59.25 
 
 		 346 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  54.34 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  58.48 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  51.48 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  45.65 
 
 		 359 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  48.36 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  56.72 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.94 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  51.5 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  45.32 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  52.61 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  41.83 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  37.38 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  42.65 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  33.94 
 
 		 326 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  40.93 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  41.23 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  32.73 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  35.12 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  37.61 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  36.03 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  40.48 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  39.15 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  38.71 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  36.71 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  39.75 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  39.81 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  40.57 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  33.79 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.75 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  38.57 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.98 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  39.74 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  44.5 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  39.22 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.07 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  37.38 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.39 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.07 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  32.51 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  40.8 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1912  Polyprenyl synthetase  38.02 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  36.28 
 
 		 297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  33.82 
 
 		 325 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.34 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  37.5 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.58 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.48 
 
 		 297 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  31.68 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  34.11 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  31.34 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  39.19 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  39.17 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  31.68 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  37.39 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  36.94 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  37.2 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.56 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  40.29 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  40.28 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  37.38 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.2 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  40.36 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.07 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  37.6 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.85 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  32.13 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  35.34 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  34.25 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.3 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2201  farnesyl-diphosphate synthase  40.09 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.58 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  34.6 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  30.06 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>