More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1696 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 339 aa  662    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  58.08 
 
 		 346 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  52.34 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  54.97 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  52.85 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  51.95 
 
 		 346 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  54.81 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  52.69 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  57.27 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  53.29 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  51.5 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  51.34 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  51 
 
 		 368 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  46.64 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  39.87 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  40.77 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  36.31 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  35.91 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  36.86 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  34.24 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  30.65 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.77 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.79 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  36 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  33.75 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.56 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  31.38 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.16 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.65 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  35.37 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  36.69 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  35.5 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  32.1 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 295 aa  143  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  39.72 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  38.77 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  36.62 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.62 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  34.76 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  34.55 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 320 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  34.84 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  36.57 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  37.61 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.05 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  39.01 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.17 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  32.18 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  38.39 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  37.32 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.6 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.99 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.44 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.91 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  38.94 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  37.84 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  38.94 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  37.96 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  31.94 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  31.94 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.4 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  31.6 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  31.94 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  39.23 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  33.58 
 
 		 297 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  38.03 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  29.51 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  32.26 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  32.64 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  35.63 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  31.83 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.94 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  37.56 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  37.56 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  30.8 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  31.06 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  34.04 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.15 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>