More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5921 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 340 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  50.6 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  51.82 
 
 		 346 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  52.89 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  51.78 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  49.86 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  55.45 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  54.18 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  49.25 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  48.96 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  47.22 
 
 		 368 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  48.63 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  43.38 
 
 		 359 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  40.88 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  41.47 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  42.7 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  32.86 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  32.57 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.69 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.45 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  34.58 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  35.55 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  36.12 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  34.24 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  34.21 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  32.77 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  35.47 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  41.43 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  34.77 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.7 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  40.67 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  39.23 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  40.67 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  36.21 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  34.66 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  34.21 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  40.76 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  31.65 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.77 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  33.12 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  34.33 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.47 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.85 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  37.91 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  34.57 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.06 
 
 		 324 aa  126  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  38.03 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  37.98 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.52 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  38.94 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  35.84 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  32.81 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  30.15 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  38 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  34.74 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  33.33 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.02 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  36.7 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  42.65 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  32.85 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.31 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  36.21 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.72 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  29.85 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  37.27 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.28 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  33.68 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  38.83 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.51 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  39.55 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  32.82 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  38.81 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  36.86 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.83 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  34.95 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  32.49 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.15 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.02 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  34.24 
 
 		 575 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  30.85 
 
 		 324 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 325 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  38.76 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  31.13 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  36.24 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>