More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0637 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  100 
 
 
340 aa  688    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  57.18 
 
 
334 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  57.48 
 
 
334 aa  364  1e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  55.72 
 
 
334 aa  355  5e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  55.43 
 
 
334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  51.33 
 
 
337 aa  317  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  32.74 
 
 
326 aa  165  8e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  34.22 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.94 
 
 
320 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  34.91 
 
 
317 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  34.28 
 
 
317 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  33.96 
 
 
317 aa  150  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  31.45 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  30.98 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.48 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.06 
 
 
322 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  30.98 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.75 
 
 
322 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.13 
 
 
320 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  31 
 
 
321 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  29.9 
 
 
322 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  29.58 
 
 
322 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  32.83 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.72 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.91 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  30.1 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.59 
 
 
324 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.42 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  29.58 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  29.51 
 
 
322 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  29.58 
 
 
322 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  31.49 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 
322 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  33.66 
 
 
331 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.81 
 
 
323 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.94 
 
 
322 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  30.49 
 
 
326 aa  139  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  33.66 
 
 
331 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  33.66 
 
 
331 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  33.66 
 
 
331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  34.74 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  29.1 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  32.92 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  32.19 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  30.18 
 
 
336 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  28.03 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  31.94 
 
 
342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 
323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  27.39 
 
 
336 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  35.29 
 
 
297 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  31.39 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  32.45 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  27.07 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  30.82 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  30.92 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  31.8 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  30.92 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.22 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  32.04 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  30.92 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  27.39 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.04 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  29.23 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  30.06 
 
 
322 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  30.06 
 
 
333 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  30.06 
 
 
322 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  28.66 
 
 
323 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.24 
 
 
333 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  30.06 
 
 
333 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  30.06 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  29.93 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  30.06 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.25 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  32.11 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.61 
 
 
324 aa  133  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  29.93 
 
 
322 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  29.21 
 
 
340 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.34 
 
 
338 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 
340 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  32.17 
 
 
323 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  30.37 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.69 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  30.26 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.49 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.29 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.39 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  30.19 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  29.45 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>