More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1206 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 334 aa  666    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  84.73 
 
 		 334 aa  578  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  81.14 
 
 		 334 aa  543  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  80.24 
 
 		 334 aa  543  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  55.72 
 
 		 340 aa  355  5e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  46.48 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  34.31 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  35.89 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  34.27 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  35.69 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  36.03 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  35.41 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  34.68 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  39.71 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  37.92 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.53 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.4 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  32.01 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.23 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  32.82 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  32.71 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  32.44 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  31.8 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  36.07 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.16 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  32.9 
 
 		 351 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  28.9 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  28.9 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.25 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  31.92 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.02 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  29.39 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.92 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.45 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  29.72 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  30.79 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  31.09 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  30.94 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  31.49 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  28.9 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.35 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  31.17 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  31.71 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  30.45 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  27.92 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  30.94 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  30.79 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  30.23 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  30.39 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  32.75 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  29.74 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  28.06 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  27.57 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  32.04 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  30.72 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  29.69 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 347 aa  125  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.75 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  33.67 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  37 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  27.78 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  28.38 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.89 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  31.45 
 
 		 346 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  29.28 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.01 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  27.51 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1909  Polyprenyl synthetase  31.06 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  34.11 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  28.71 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  27.78 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  34.11 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  28.38 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  34.11 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  34.89 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.67 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>