More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5744 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  100 
 
 		 323 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  67.08 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  54.95 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  50.47 
 
 		 322 aa  298  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  46.84 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  44.97 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  46.91 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  43.35 
 
 		 321 aa  266  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  42.45 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  38.99 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  39.3 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  42.11 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  38.51 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  37.33 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  38.98 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  35.94 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  35.64 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  40.66 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  35.37 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  35.9 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  41.94 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  36.23 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  41.78 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  35.83 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.16 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  34.1 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  36.78 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  40.41 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  39.33 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  39.82 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  35.37 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  34.22 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 346 aa  155  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  39.46 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.01 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  32.47 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  32.76 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.46 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  31.27 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.07 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  31.67 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  32.4 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  31.43 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  34.87 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  29.49 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  32.77 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  36.11 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.32 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  32.84 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  33.95 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  34.41 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.65 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.6 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  35.78 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  32.23 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  32.92 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  30.23 
 
 		 322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  35.1 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  36.7 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  36.53 
 
 		 340 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  32.58 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  32.87 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  36.53 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  36.49 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.72 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  31.86 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  33.03 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.79 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  31.72 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  33.19 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  36 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  34.42 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  29.47 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  33.79 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  32.27 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  32.75 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.74 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  34.89 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.56 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  30.66 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>