More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2209 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  100 
 
 		 325 aa  663    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  61.44 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  60.5 
 
 		 320 aa  403  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  56.11 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  57.5 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  47.46 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  44.55 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  45.51 
 
 		 349 aa  255  9e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  45.42 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  42.06 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  42.73 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  45.83 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  43.37 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  45.12 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  45.16 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  37.65 
 
 		 326 aa  205  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.68 
 
 		 317 aa  202  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  41.74 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  41.08 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  43.97 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  38.96 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  41.78 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  44.29 
 
 		 331 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  42.38 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  44.29 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.59 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  41.15 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  41.43 
 
 		 330 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  41.43 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  37.83 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  38.2 
 
 		 324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.47 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  36.04 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  34.95 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  36.05 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  32.2 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  32.2 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.99 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  33.53 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  32.66 
 
 		 318 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.88 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  41.32 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  32.93 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  36.64 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  31.08 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  32.1 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  36.02 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  32.41 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  31.79 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  32.27 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  31.86 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  33.67 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  36.11 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.44 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.04 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  30.91 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  33.67 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.09 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  34.19 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  38.99 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.63 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  39.45 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  38.91 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.01 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  31.23 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.04 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  33.74 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  33.22 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.29 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  28.79 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  32.44 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  30.89 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.86 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  32.92 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  28.79 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  31.31 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.21 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  34.06 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>