More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1446 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  100 
 
 		 331 aa  679    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  81.1 
 
 		 337 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  78.42 
 
 		 332 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  75.68 
 
 		 330 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  74.77 
 
 		 332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  73.48 
 
 		 337 aa  504  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  70.52 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  40.66 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  36.67 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  38.51 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  42.53 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  41.57 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  35.97 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  36.94 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  36.51 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  37.68 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.02 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  38.63 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  35.76 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.31 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.91 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  34.96 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  35.35 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  36.54 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  36.62 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  44.29 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  35.44 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  32.73 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  32.02 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  42.52 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  36.5 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.65 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  30.92 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  32.07 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  32.07 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  30.91 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  31.72 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  31.83 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.42 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  32.53 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  30 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  30.58 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  30.34 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  33.88 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  31.4 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  32.55 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.56 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  32.65 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  32.6 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  29.94 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.27 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  30.1 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  38.3 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  38.06 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  32.13 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  34.8 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  30.69 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  30.8 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  30.8 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  30.8 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  30.8 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  30.8 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.76 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.14 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.85 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  34.46 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.1 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.1 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  31.14 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.1 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  31.19 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  30.1 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  34.83 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  29.76 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  30.1 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>