More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2372 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 320 aa  647    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  68.77 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  60.5 
 
 		 325 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  58.75 
 
 		 320 aa  374  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  51.55 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  44.17 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 348 aa  258  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  44.31 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  45.19 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  45.19 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  43.91 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  44.62 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  44.03 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  42.18 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  41.15 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  40.69 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  37.19 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.62 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  41.08 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  38.04 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.15 
 
 		 317 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  41.04 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  36.62 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  36.98 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.98 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  39.82 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  42.52 
 
 		 331 aa  165  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  43.36 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  37.87 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.19 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  42.06 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  41.12 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  39.63 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  33.56 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  39.25 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  42.99 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  33.87 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  40.09 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  40.39 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  34.84 
 
 		 333 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  31.85 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  31.01 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.13 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36.63 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  33.65 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  31.42 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  39.44 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  36.77 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.87 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  32.48 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  34.43 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  32.37 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  32.91 
 
 		 328 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  40.23 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  36.97 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.71 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  35.35 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  32.62 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  32.27 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  33.66 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.08 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  39.44 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.58 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.35 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  35.53 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  37.14 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  41.2 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.05 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  38.61 
 
 		 359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.67 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  34.87 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.06 
 
 		 340 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  35.06 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  33.63 
 
 		 349 aa  145  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.3 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  38.32 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  31.19 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.71 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  29.75 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.86 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  39.81 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.1 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.73 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  32.06 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  32.7 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>