More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13433 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  100 
 
 		 359 aa  718    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  49.54 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  45.27 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  49.26 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.62 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  52.34 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  48.31 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  47.06 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  44.73 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  45.65 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  47.71 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  47.08 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 343 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  39.58 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  36.99 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  41.99 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  31.6 
 
 		 332 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  39.04 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  36.9 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  36.57 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  40.7 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.77 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  34.25 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  37.17 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  31.47 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  43.43 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  36.08 
 
 		 320 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  34.25 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  38.3 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  35.09 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  29.11 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  32.88 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  31.6 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  34.1 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.76 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  34.55 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  41.92 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  43.35 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.21 
 
 		 322 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.68 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 294 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.45 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.31 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  42.6 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.97 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  31.01 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  31.66 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  33.73 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  39.91 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  34.37 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  38.74 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  28.21 
 
 		 322 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.71 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  30.71 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.43 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  39.57 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  33.06 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  31.01 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.83 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  37.56 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  40.87 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.09 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  39.9 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.91 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  28.08 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.33 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  30.46 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.38 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  29.75 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  37.8 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  30.51 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  39.9 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  29.48 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  35.86 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.38 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.99 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.53 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  32.53 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  32.64 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  32.65 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  32.14 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  40.1 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  32.64 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.33 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  35.86 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  39.9 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  31.72 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.41 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  34.01 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  29.03 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>