More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1604 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 343 aa  686    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  63.45 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  62.87 
 
 		 338 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  54.79 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  43.84 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  40 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.45 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  44.69 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  41.8 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  37.38 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  41.79 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  35.91 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  39.63 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.07 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  37.01 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  38.85 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 338 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.69 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  33.08 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  30.27 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.47 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  42 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  34.13 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  33.56 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  36.97 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  36.87 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.22 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  31.34 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  39.17 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  32.37 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.49 
 
 		 354 aa  142  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  33.47 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  28.08 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  33.71 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.46 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  33.21 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  31.44 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.57 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  31.03 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.06 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.84 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  37.84 
 
 		 330 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  33.69 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  30.72 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.33 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  32.58 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  36.61 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.41 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.2 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  31.56 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  28.61 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  33.2 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  32.23 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  40.27 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.01 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  38.25 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.94 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  30.98 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  35.89 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.05 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.42 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  29.15 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  33.59 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  32.86 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  33.2 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  29.5 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  37.79 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.29 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  32.79 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  33.61 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  36.2 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  36.19 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.53 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  30.48 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  32.78 
 
 		 317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.62 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  27.94 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  30.8 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>