More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1618 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 329 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  53.94 
 
 		 332 aa  301  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  52.91 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  46.51 
 
 		 386 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  46.51 
 
 		 386 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  46.12 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.91 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.76 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  37.24 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  37.21 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  39.57 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.91 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  31.93 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  31.93 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.15 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.68 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  33.86 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.38 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.51 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  35.61 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  33.2 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  34.32 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  32.76 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  36.93 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  28.52 
 
 		 326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.17 
 
 		 321 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.55 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.99 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  28.14 
 
 		 350 aa  112  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.04 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  36.43 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.02 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.48 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  31.07 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.86 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  35.13 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  36 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  31.56 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  30.56 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  30.67 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  33.71 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  33.01 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  33.71 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.42 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  32.13 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.79 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  31.6 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  28.81 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  30.61 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.79 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  33.13 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  36.03 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.95 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  30.29 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  38.12 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  37.22 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.11 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.23 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.86 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.77 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  32.99 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  32.21 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.57 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.57 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.7 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  30.91 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  29.39 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  34.17 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  31.89 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.82 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  34.96 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  31.64 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  34.73 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  36.8 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.75 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  32.94 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  28.35 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  33.81 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1972  trans-hexaprenyltranstransferase  36.63 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  31.94 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  28.62 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.78 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  29.51 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>