More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1275 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 343 aa  694    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  43.46 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  36.16 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  37.28 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  36.99 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  36.9 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  35.44 
 
 		 345 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  33.73 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  34.87 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  36.08 
 
 		 346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  36.39 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  39.25 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  35.63 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  37.9 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.26 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.26 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  30.98 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  35.91 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.16 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  38.29 
 
 		 338 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  36.15 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  32.84 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  34.13 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  34.18 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  38 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  31.39 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  35.89 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  31.97 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.82 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.82 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  35.53 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  33.46 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.94 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  33.48 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  34.4 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  37 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  30.94 
 
 		 327 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  32.26 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  30.8 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  32.94 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  32.61 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  36 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.97 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  31.97 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  33.71 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  37.75 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  33.8 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  34.93 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  33.49 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  30.47 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  33.48 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.39 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.53 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  36.1 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  34.27 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.29 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  29.37 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  33.8 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.35 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  33.8 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  33.8 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.88 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  30.97 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.02 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  35.02 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  36.46 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  32 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  29.21 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  29.28 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  35.61 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  30.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  32.86 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  28.48 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  25.24 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  32.31 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  29.43 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  37.21 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  27.81 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.08 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  27.89 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  33.63 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  29.43 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  29.77 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  29.63 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  29.63 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  29.63 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>