More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3714 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  100 
 
 		 350 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  58.82 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  58.11 
 
 		 346 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  54.25 
 
 		 346 aa  328  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  58.48 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  51.61 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  53.89 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  50.28 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  55.45 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  48.39 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  44.8 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  46.87 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  53.72 
 
 		 338 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  42.9 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  40.32 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  40.8 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  36.23 
 
 		 326 aa  166  8e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  31.69 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  33.45 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  35.29 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  44.04 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  32.18 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  36.94 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  31.01 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  35.14 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  29.81 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.07 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  35.57 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  32.2 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  32.2 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.88 
 
 		 327 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  34.62 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  30 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  38.19 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  38.27 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 295 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.38 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  35.98 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  38.82 
 
 		 297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.87 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  39.35 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  31.31 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  35.02 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4379  Polyprenyl synthetase  37.39 
 
 		 557 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 295 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.08 
 
 		 322 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  28.52 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  30.53 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  29.02 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.26 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  30.71 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  32 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  35.98 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.72 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.51 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.06 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  39.38 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  34.56 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  34.26 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.38 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.94 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  38.73 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.38 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  31.8 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.9 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  40.54 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  38.99 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  37.95 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  39.21 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  35.23 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  31.38 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.95 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0636  polyprenyl synthetase  35.9 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  30.3 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  36.52 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  40.09 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.7 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  34.7 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  30.14 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  31.38 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  33.18 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.46 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>