More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0384 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 332 aa  680    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  80.12 
 
 		 337 aa  552  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  79.52 
 
 		 332 aa  552  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  76.97 
 
 		 330 aa  535  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  78.42 
 
 		 331 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  72.29 
 
 		 332 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  73.8 
 
 		 337 aa  511  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  39.68 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  39.29 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  44.23 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  35.46 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  37.11 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  36.75 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  37.65 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  36.67 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  33.02 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  36.33 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.46 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  38.39 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  35.67 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  34.88 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.1 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  33.97 
 
 		 320 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  33.67 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 348 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  41.43 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.76 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  39.25 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  30.23 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.02 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  32.18 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  29.97 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  37.39 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  29.11 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.49 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  30.58 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.49 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.49 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  34.88 
 
 		 349 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  31.74 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.55 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.49 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  32.3 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.16 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  30.88 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  29.35 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  31.49 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  31.49 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  31.49 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  31.49 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  30.69 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  31.49 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  31.49 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.2 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  34.55 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 344 aa  149  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.64 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  30.35 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  34.55 
 
 		 349 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  36.78 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  30.45 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  30.45 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  30.45 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  30.56 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  30.45 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  30.8 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  30.45 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  30.45 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  31.94 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  34.9 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  30.45 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  33.44 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30.34 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  29.07 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  31.14 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  38.3 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  31.94 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  30.1 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  31.25 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  28.72 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.03 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  29.39 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.03 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>