More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1816 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  100 
 
 		 321 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  68.77 
 
 		 320 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  61.44 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  62.03 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  55.97 
 
 		 322 aa  339  4e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  47.34 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  49.2 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  47.66 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  49.32 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  48.23 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  48.55 
 
 		 349 aa  245  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  48.54 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  43.9 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  44.9 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  43.22 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  43.31 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 317 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  44.84 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  47.03 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  37.27 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  41.32 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.89 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  35.29 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  36.62 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  36.19 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  40.41 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  39.19 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.57 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  36.07 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.59 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  39.46 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  38.23 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  34.77 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  44.25 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  38.94 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  35.1 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.36 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  39.33 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  38.64 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  42.31 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.06 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  32.81 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  37.29 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.68 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  37.12 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  38 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  33.11 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  33.11 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.49 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  38.74 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.65 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  32.66 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  32.41 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.06 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  30.32 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.52 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  32.42 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  30.91 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.52 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  36.21 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.52 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  32.14 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  36.23 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  30.97 
 
 		 322 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  39.13 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.93 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  34.55 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  35.57 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  32.88 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  36.03 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  32.19 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  32.82 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.6 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  30.93 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  30.12 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  32.2 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.91 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  32.72 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.65 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.66 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.68 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  39.2 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.8 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  33.33 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.34 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>