More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1042 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  100 
 
 		 332 aa  672    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  55.18 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  39.81 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  39.63 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  39.32 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  40.57 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  39.01 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  45.12 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  43.54 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  44.03 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  40.64 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  39.67 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  40.58 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  47.03 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.86 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  41.63 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.48 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  43.57 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  33.96 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.47 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  37.66 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.6 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.6 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  32.34 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  33.65 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  32.72 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  41.94 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  33.65 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  31.76 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  32.72 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  33.74 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  32.63 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  31.6 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  37.54 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  31.76 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.55 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  30.63 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  32.38 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  33.12 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  31.18 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  34.16 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.81 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  34.95 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  32.8 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  31.87 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  31.56 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  31.45 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  32.81 
 
 		 336 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  32.8 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  32.8 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  31.87 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  32.8 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  31.87 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  39.52 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  33.22 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  34.37 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  34.71 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  32.8 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  32.49 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  32.57 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  37.02 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  31.68 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  36.16 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.18 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.03 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  29.06 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  28.17 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  36.08 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  36.4 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  32.7 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  33.85 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.42 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 337 aa  166  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.71 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  35.02 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.85 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  31.33 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.09 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.1 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  30.91 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>