More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0606 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  100 
 
 		 337 aa  673    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  51.33 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  48.01 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  47.09 
 
 		 334 aa  285  7e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  47.92 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  46.48 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.08 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.9 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  36.2 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.6 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.54 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.52 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.8 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  35.6 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.67 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  33.93 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  32.55 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  32.35 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  32.67 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.87 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.9 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  34.69 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  34.48 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.23 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  33.11 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  33.82 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.23 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.23 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.23 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.23 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.26 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.29 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.26 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.9 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.58 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  32.9 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  34.15 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  31.6 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.82 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  33.89 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  32.54 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.81 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  30.4 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  31.36 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  32.89 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  30.1 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  31.01 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.03 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  30.09 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  37.45 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  30.46 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  31.76 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  33.59 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  32.89 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  30.27 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  27.58 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  31.56 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.33 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  31.77 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  32.31 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.64 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  38.65 
 
 		 368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  32.67 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.89 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  30.72 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.36 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.23 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  33.01 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.36 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  30.87 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  29.52 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  37.17 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  30.84 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  28.08 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  29.94 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  29.94 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  31.68 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  34.18 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  32.34 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  28.85 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  31 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  27.9 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  31 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.46 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  30.82 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  33.54 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  32.33 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>