More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1997 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 368 aa  712    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  49.58 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  50.28 
 
 		 346 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  44.73 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  49.58 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  47.75 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 		 335 aa  236  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  52.73 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  49.15 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  50.14 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  45.51 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  45.56 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  48.38 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  40.24 
 
 		 350 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  44.4 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  37.31 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  43.98 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  38.44 
 
 		 339 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  38.99 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  37.9 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  35.44 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  39.45 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  34.04 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  37.73 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.12 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  38.46 
 
 		 327 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.04 
 
 		 317 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  38.18 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  38.57 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  33.82 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  35.56 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  36.67 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  36.45 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  31.71 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  41.09 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.58 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.45 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  38.73 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  38.12 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  33.7 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  34.84 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  34.87 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  40.18 
 
 		 296 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  32.59 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  37.83 
 
 		 297 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  36.4 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  36.23 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.09 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.73 
 
 		 294 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  37.25 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  41.15 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  29.73 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.64 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  42.06 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.07 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  41.59 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  36 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  42.13 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  36.47 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  37.67 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  39.91 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  40.09 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  40.16 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  38.65 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  37.26 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  34.21 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  39.63 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  39.63 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  40.28 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  40.55 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  34.02 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  40.28 
 
 		 297 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  33.94 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.48 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  32.93 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  37.85 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  37.73 
 
 		 300 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.32 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  29.63 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.71 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  27.1 
 
 		 326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  37.2 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.78 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  42.61 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>