More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0763 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 346 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  60.98 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  62.9 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  54.34 
 
 		 346 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  51.91 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  49.58 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  45.27 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.39 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  51.95 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  48.66 
 
 		 338 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  46.55 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  49.1 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  49.09 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  41.44 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  40.18 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  39.58 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  35.01 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.86 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  35.07 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  38.94 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  35.07 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  30.99 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  40.67 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  39.32 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  38.65 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.58 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  40.57 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.62 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.07 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  42.33 
 
 		 295 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.74 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  38.87 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  32.89 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  37.98 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  36.76 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  31.82 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  29.47 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  34.02 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  33.61 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  27.38 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  36.49 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  33.2 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  32.93 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28.81 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 334 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  32.96 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  36.03 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0637  polyprenyl synthetase  30.67 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  38.39 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  29.18 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  33.83 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  36.26 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  39.91 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  30.42 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.29 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.92 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  36.86 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  37.09 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  32.31 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  34.15 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.58 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  34.88 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  32.06 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  31.82 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  31.73 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.66 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  27.18 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.68 
 
 		 324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  31.92 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  31.73 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.73 
 
 		 322 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  38.32 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  31.6 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  29.39 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.27 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  30.69 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.18 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.76 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  40.19 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.95 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  40.93 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  29.58 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  30.43 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>