More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1465 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 345 aa  712    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  40.91 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  40.58 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4493  polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 339 aa  212  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000291603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  37 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  35.44 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  33.92 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  37.17 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1997  Polyprenyl synthetase  34.04 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0211657  normal  0.0925303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  32.01 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  37.71 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  36.53 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.14 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  36.55 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  31.67 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  29.24 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3714  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  39.93 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000327917  normal  0.60035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  30.48 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  28.97 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  37.02 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4971  Polyprenyl synthetase  35.25 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  33.02 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  38.63 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  39.29 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  31.6 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  28.3 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  34.22 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  30.56 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  31.32 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  33.83 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  32.24 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  32.02 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.31 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  32.84 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  33.08 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1696  polyprenyl synthetase  40.08 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000054414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  30.8 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  31.91 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  28.53 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  33.08 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  35.46 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  33.05 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.82 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  30.34 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  36.97 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  29.84 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  33.89 
 
 		 330 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4379  Polyprenyl synthetase  33.08 
 
 		 557 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  32.69 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  32.6 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  32.36 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6665  Polyprenyl synthetase  36.15 
 
 		 338 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  31.7 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  32.6 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  37.32 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.61 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  36.74 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  29.04 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  31.82 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  31.25 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 307 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  33.77 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  32.28 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.97 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  32.08 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  35.89 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  29.29 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  30.48 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  31.8 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.06 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  29.43 
 
 		 295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  31.1 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  35.06 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  32.59 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  30.67 
 
 		 297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  28.21 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  31.53 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  30.47 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  31.44 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  31.84 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  29.21 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  29.15 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  30.19 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  31.37 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  34.1 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  29.41 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0687  polyprenyl synthetase  27.3 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169435  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  31.08 
 
 		 297 aa  113  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  30.08 
 
 		 309 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  29.47 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>