More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1537 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1537  polyprenyl synthetase family protein  100 
 
 		 350 aa  718    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  35.52 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3242  Polyprenyl synthetase  32.84 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  32.4 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.9 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  35.29 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  32.24 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  35.14 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  31.71 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  33.57 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  30.42 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  35.91 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00654  Geranylgeranyl diphosphate synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I1]  32.77 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.47 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  32.63 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  29.43 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  33.09 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  34.05 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  29.01 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.06 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  33.04 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.11 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  32.13 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.08 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  32.77 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01592  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0108792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  28.83 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  29.74 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  31.7 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  29.93 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.65 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  29.93 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  29.93 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  27.12 
 
 		 338 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  33.64 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  32.72 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.73 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30.56 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.08 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  30.92 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  34.13 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  31.71 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0241  Polyprenyl synthetase  35.18 
 
 		 280 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  35.06 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  27.91 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  30.31 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.66 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  31 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  29.18 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4923  Polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 768 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  27.22 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.15 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  29.67 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.11 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  28.95 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  30.33 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  33.89 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  29.86 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  28.79 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  27.24 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  30.61 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  30.8 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  31.28 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  28.43 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  33.95 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  30.18 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  30.33 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  29.79 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  27.91 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  27.09 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  27.3 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  28.41 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.4 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  29.93 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  28.89 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0895  bifunctional short chain isoprenyl diphosphate synthase  29.48 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  32.23 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  33.47 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  31.65 
 
 		 297 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2818  Polyprenyl synthetase  31.1 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  27.49 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  30.04 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.72 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  30.39 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  30.42 
 
 		 933 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.14 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  27.48 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  28.37 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  27.37 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0208  trans-hexaprenyltranstransferase  32.6 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  28.53 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  30.23 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>